Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SbdsP70122 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SbdsP70122 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SbdsP70122 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms