Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubb4bP68372 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubb4bP68372 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms