Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SnrpnP63163 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpnP63163 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms