Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Crnkl1P63154 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crnkl1P63154 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms