Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tra2bP62996 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms