Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ube2d2P62838 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d2P62838 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms