Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsnl1P62761 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms