Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snrpd1P62315 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snrpd1P62315 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms