Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SnrpfP62307 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpfP62307 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms