Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp46P62069 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp46P62069 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp46P62069 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp46P62069 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp46P62069 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp46P62069 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp46P62069 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp46P62069 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp46P62069 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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