Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copz1P61924 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Copz1P61924 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms