Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga11P61622 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga11P61622 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms