Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arf3P61205 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arf3P61205 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arf3P61205 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arf3P61205 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arf3P61205 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arf3P61205 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arf3P61205 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf3P61205 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms