Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2kP61087 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms