Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snap25P60879 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snap25P60879 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap25P60879 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms