Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ppfia3P60469 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ppfia3P60469 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms