Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdo1P60334 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms