Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eif3eP60229 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eif3eP60229 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms