Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ythdf1P59326 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms