Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhbdl3P58873 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhbdl3P58873 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms