Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpaP58389 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms