Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Uchl4P58321 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl4P58321 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms