Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smpdl3bP58242 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms