Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tm9sf2P58021 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms