Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn18P56857 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn18P56857 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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