Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lim2P56563 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lim2P56563 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms