Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irf5P56477 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Irf5P56477 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms