Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp5P56399 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp5P56399 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms