Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CdaP56389 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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CdaP56389 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CdaP56389 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CdaP56389 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CdaP56389 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CdaP56389 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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