Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atp5eP56382 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms