Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp1P56183 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1P56183 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms