Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp1P55194 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1P55194 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms