Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GemP55041 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GemP55041 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GemP55041 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GemP55041 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GemP55041 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GemP55041 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GemP55041 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GemP55041 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GemP55041 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GemP55041 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GemP55041 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GemP55041 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms