Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ephb3P54754 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ephb3P54754 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms