Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rad23aP54726 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad23aP54726 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms