Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CnbpP53996 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CnbpP53996 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CnbpP53996 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CnbpP53996 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms