Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e3P52483 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e3P52483 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms