Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcnfP51944 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CcnfP51944 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms