Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ApodP51910 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ApodP51910 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ApodP51910 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ApodP51910 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms