Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Defa-rs12P50716 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs12P50716 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms