Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhx3P50481 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhx3P50481 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms