Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SftpdP50404 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SftpdP50404 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms