Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc13P50207 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc13P50207 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms