Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BckdhaP50136 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BckdhaP50136 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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