Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CitP49025 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CitP49025 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CitP49025 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CitP49025 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CitP49025 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CitP49025 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CitP49025 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms