Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atoh1P48985 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atoh1P48985 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms