Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox2P48432 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms