Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrprbP47758 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrprbP47758 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrprbP47758 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms