Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdkn1bP46414 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cdkn1bP46414 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms