Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms